El Grupo de Alerta y Control (GRUALERCON), dependiendo operativamente del Comandante del Mando de Defensa y Operaciones Aéreas (CMDOA), tiene como misión contribuir permanentemente a las operaciones de Vigilancia, Seguridad, Control y Policía Aérea en los espacios aéreos de soberanía, responsabilidad e interés nacional.
Para ello, proporciona vigilancia de dichos espacios aéreos, con especial énfasis en donde pueda originarse la amenaza, dando respuesta a cualquier intrusión en el espacio aéreo de soberanía nacional, las 24 horas del día, los 7 días de la semana.
Por otra parte, el GRUALERCON forma parte del Sistema Integrado de Defensa Aérea y contra Misiles de la OTAN (NATINAMDS), dependiendo del Centro de Operaciones Aéreas Combinadas de Torrejón (CAOC-TJ).
La Unidad tiene integrado el Centro Zonal de Mantenimiento (CEZMAN) número 9 de Sistema de Telecomunicaciones Militares (STM), teniendo como cometidos la supervisión y el mantenimiento del STM en la provincia de Las Palmas.